中国药理学与毒理学杂志

期刊导读

中药学论文_基于生物信息学分析和网络药理学探

来源:中国药理学与毒理学杂志 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-11-02

文章摘要:目的 基于生物信息学分析和网络药理学探讨黄连解毒汤(HuanglianjieduDecoction,HLJDD)延缓或抑制动脉粥样硬化(AS)由稳定斑块到破裂过程的作用机制。方法 首先,从GEO和ArrayExpress数据库中获取含有人颈AS稳定和破裂斑块的数据集;利用limma包和wilcoxTest来筛选差异表达基因(DEGs),再用稳健排序整合(RRA)方法筛选稳健DEGs,并进行富集分析。其次,利用TCMSP和SwissTargetPrediction数据库筛选HLJDD的活性成分及其作用靶点,并与稳健DEGs取交集,获取HLJDD-AS交集DEGs。然后,对交集DEGs进行功能富集分析,并构建蛋白互作(PPI)网络,筛选PPI网络中的子模块和Hub基因。最后,利用AutodockVina软件,将Hub基因与其所对应HLJDD的活性成分进行分子对接。结果RRA法共鉴定出864个稳健DEGs,其功能主要涉及中性粒细胞的脱颗粒、活化、炎症反应、趋化因子信号通路、PPAR信号通路、细胞粘附分子等。筛选出HLJDD有84个活性成分,928个作用靶点,获得HLJDD-AS交集DEGs有42个。GO和KEGG分析显示,交集DEGs主要涉及胶原蛋白的分解代谢、组织重构、中性粒细胞的脱颗粒、活化、PPAR信号通路、补体与凝血级联反应等。在PPI网络中,共筛选2个子模块,7个Hub基因。分子对接的结果显示,7个Hub基因与其对应HLJDD的活性成分表现出了良好的亲和力。结论 本研究揭示了以清热解毒为治则的HLJDD有效抑制或延缓AS斑块破裂的作用机制,为中医从毒论治AS易损斑块提供一定的科学依据。

文章关键词:

论文分类号:R285